Soppinfeksjoner oppstår ofte fra en enkel ubalanse mellom mikroorganismer som er naturlig tilstede i kroppen.

Det er faktisk kolonisert av et mangfold av varierte sopp og bakterier, mesteparten av tiden ufarlig og til og med avgjørende for kroppens funksjon.

Imidlertid kan det skje at noen av disse soppene formerer seg og blir patogene, eller at en "ekstern" sopp, for eksempel overført av et dyr, forårsaker en infeksjon. Totalt 200-400 sopparter kan forårsake sykdom hos mennesker⁵.

Imidlertid kan sopp i miljøet også forurense mennesker, for eksempel:

• ved inokulering, for eksempel under en skade (som fører til sporotrichose eller kromomykose, etc.);
• ved innånding av muggsopp (histoplasmose, apergillose, etc.);
• ved kontakt med en infisert person (candidiasis, ringorm, etc.);
• gjennom kontakt med et infisert dyr.